Scenario Packs
三个场景包,同一套可信度规矩。
场景包是最小可评审单元:机制、端点、训练/验证任务、公开数据来源与 COU 一起打包、一起版本化。v1 优先小鼠公开数据建立可信度基线。论文稿当前默认主线为 Influenza(小鼠)+ MC38,可替换。
§ 0
同一规则书下的三条机制主线
每个场景必须提供:机制链说明、端点定义、观测模型、训练/验证隔离、至少一个 L1;鼓励 L2(统一设计倾向药理阻断/耗竭)。
无公开数据跑通前,本站不展示拟合误差或通过结论。
§ 1
场景 A · 呼吸道病毒
机制链:IFN → NK → CTL → 抗体。默认主线 Influenza 样(可替换)。
默认主线
Influenza 样小鼠呼吸道病毒
可替换
| 类别 | 内容 |
|---|---|
| 端点 | Tclear · Vpeak / tpeak · 炎症 AUC |
| L1 | 初始载量 ×10;抗病毒药第 2 天给药 |
| L2 | NK 招募降低;IFN 通路抑制 |
| Phase | Phase 0 最小闭环优先 |
结构示例
measurement_model 片段(结构示例)
name: virus_load_log10
y_obs: log10(virus_count / volume + eps)
aligns_to: public_data.column.virus_titer
lod: "<assay LOD placeholder>"
noise: "homoscedastic_or_declared"§ 2
场景 B · 细菌感染
机制侧重:中性粒 · 补体 · 巨噬。小鼠器官 CFU 路径。
| 类别 | 内容 |
|---|---|
| 端点 | 清除时间 · 组织损伤 AUC · 脓毒倾向指数 |
| L1 | 抗生素时机 / 剂量 |
| L2 | 中性粒招募或杀伤缺陷 |
| Phase | Phase 1 |
§ 3
场景 C · 肿瘤免疫
机制:肿瘤增长 · 免疫抑制 · PD-1。默认主线 MC38 样(可替换)。
默认主线
MC38 样肿瘤免疫
可替换
| 类别 | 内容 |
|---|---|
| 端点 | 肿瘤体积 · TGI@dayX · 耗竭指数 |
| L1 | PD-1 时机 / 剂量 |
| L2 | Treg / MDSC 增强、抗原性下降 |
| Phase | Phase 1 |
§ 4
公开数据与小鼠优先
业主确认小鼠优先:时间序列更完整可控;异质性更小;更易做 L2;观测模型(PFU、CFU、卡尺体积等)更易审计。
数字化公开论文图必须保留脚本、原始文件 hash 与 digitization_error_band,防止误差反噬校准。
§ 5
场景包目录结构(示例)
字段与目录为结构示意;数值占位不得当作结果。
结构示例
scenario_pack/
scenario_pack/
cou.yaml
mechanisms.md
endpoints.yaml
measurement_models/
tasks/
train.yaml
validate_L1.yaml
validate_L2.yaml
public_data/
presets/